В кровотоке найден молекулярный отпечаток опухолей молочной железы, связанный с иммунным ответом
Прислано Sergey на 29 Сентября 2017, 17:37:18
Молекулярный отпечаток  Используя недавно разработанное программное обеспечение, исследователи показали, что гены и молекулярные процессы в опухолевых клетках рака молочной железы тесно связаны с генами и процессами в клетках крови, включая клетки иммунной системы.

Результаты опубликованы в PLOS Computational Biology.

Даже если опухоль не метастазируется, ее клетки распространяются далеко за пределы той части тела, в которой она обнаружена. Например, опухоль влияет на экспрессию генов в клетках иммунной системы , которые участвуют в реакции организма на рак. Эти клетки циркулируют по всему телу в кровотоке...
Расширенные новости
Молекулярный отпечаток  Используя недавно разработанное программное обеспечение, исследователи показали, что гены и молекулярные процессы в опухолевых клетках рака молочной железы тесно связаны с генами и процессами в клетках крови, включая клетки иммунной системы.

Результаты опубликованы в PLOS Computational Biology.

Даже если опухоль не метастазируется, ее клетки распространяются далеко за пределы той части тела, в которой она обнаружена. Например, опухоль влияет на экспрессию генов в клетках иммунной системы , которые участвуют в реакции организма на рак. Эти клетки циркулируют по всему телу в кровотоке.

В новом исследовании группа во главе с Ванессой Думо в Университете Макгилла изучала связи между экспрессией генов в опухолях рака молочной железы и в кровотоке. Они построили новый программный инструмент под названием MIxT (согласованные взаимодействия между тканями), который использует вычислительные и статистические методы для поиска и исследования связей между экспрессией генов в разных тканях организма.

Команда использовала MIxT для анализа экспрессии генов в соответствии с последовательностями РНК, обнаруженными в образцах крови и опухолей у 173 пациентов с раком молочной железы. Программное обеспечение позволило им сгруппировать гены в группы, связанные с конкретными молекулярными процессами, и посмотреть, какие процессы в опухолях и клетках крови были связаны друг с другом.

Анализ показал, что связи между молекулярными процессами в опухолях рака молочной железы и кровотоком действительно существуют, но они варьируются в зависимости от подтипа опухоли. Например, исследователи обнаружили процессы подавления иммунной системы, действующие в сочетании с некоторыми подтипами рака молочной железы, включая подтип базального рака молочной железы.

«Эта работа перемещает сообщество за пределы барьеров большинства предыдущих молекулярных исследований, которые сосредоточены исключительно на иммунных клетках в микроокружении опухоли, обеспечивая более общую картину того, как наши тела и иммунная система реагируют на проблемы присутствия конкретной опухоли».

Выводы могут привести к дальнейшему исследованию потенциальных новых способов лечения и мониторинга рака молочной железы, если смотреть за пределы опухоли и использовать ответ иммунной системы пациента.


Больше информации:

Interactions between the tumor and the blood systemic response of breast cancer patients